Le Jura est riche en témoignages d’anciennes implantations humaines, car dès la fin des grandes glaciations, ses terres libres de glace sont colonisées par quelques tribus. Les sites archéologiques les plus importants datent du Haut Moyen-Age. C’est à cette époque que la région commence à exporter son minerai de fer vers le plateau helvétique, ce qui stimule son développement.

Quiquerez est d’ailleurs devenu le spécialiste incontesté de l’histoire de la sidérurgie jurassienne et le pionnier, à l’échelle européenne, de l’archéologie du fer et de la géologie minière. En 1866, il publie une oeuvre magistrale, De l’âge du fer (réédité en 1992), où il résume toutes les recherches qu’il a conduites dans ce qu’on appelle aujourd’hui le «District sidérurgique du Jura central suisse».

Il y fait preuve de connaissances techniques étendues et y recense et décrit personnellement quelque deux cents ferriers, ainsi que d’anciens bas fourneaux. Son attrait pour l’archéologie s’étend également à d’autres domaines. De 1822 à 1882, alors qu’il parcourt le Jura sans relâche, il décrit avec la passion de l’inventeur tous les vestiges humains qu’il y rencontre. Voies de communication, camps, castels, villas, tumuli... rien ne lui échappe. Tous ses travaux et les différents trophées qu’il ramène de ses quêtes transforment peu à peu sa villa et son château en un véritable musée jurassien avant la lettre.